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Deep learning and CRISPR-Cas13d ortholog discovery for optimized RNA targeting - ScienceDirect需要有效和精确的哺乳动物转录组工程技术来加速生物发现和RNA治疗。尽管可编程CRISPR-Cas13核糖核酸酶有希望,但由于对指导RNA设计规则和脱靶或侧链RNA切割导致的细胞毒性的不完全了解,它们的实用性受到了阻碍。在这里,我...
Precise RNA targeting with CRISPR–Cas13d | Nature BiotechnologyCas13的的侧枝RNA降解的可能性引起了对转录组扰动,影响CRISPR–cas 13的治疗应用。研究表明,侧枝活性只发生在高RfxCas13d表达的情况下。在转录组规模和组合池筛选中使用低拷贝RfxCas13d,我们实现了高靶向敲除,而没有广泛的侧枝活动。此外,对高保真Ca...
High-fidelity Cas13 variants for targeted RNA degradation with minimal collateral effects | Nature BiotechnologyCRISPR/Cas13系统是操作RNA的可编程工具,用于各种RNA靶向应用。在Cas13家族中,Cas13d是哺乳动物细胞中最活跃的亚型。最近,Cas13d被用作针对不同人类RNA病毒的抗病毒药物。然而,Cas13d在哺乳动物细胞...
Full article: Programmable RNA targeting with CRISPR-Cas13RNA靶向CRISPR-Cas13系统实现了内源RNA的精确工程,大大推进了我们对RNA调控的理解和基于RNA的诊断和治疗应用的开发。本文旨在总结基于Cas13的RNA靶向工具及其应用,讨论现有工具的局限性和挑战,并为RNA靶向系统的进一步发展提出潜在的方向。作为可编程核糖核酸...
MicroRNAs是转录后调节因子,控制mRNA的稳定性和靶基因的翻译效率。成熟的微小RNA大约有22个核苷酸长。它们通过结合靶mRNAs中的不完全互补序列(又名微小RNA调节元件,MRE)来介导转录后基因调节。据估计,人类基因组中超过三分之一的蛋白质编码基因受微小核糖核酸调控。检测miRNA和它在mRNA中的靶向位点之间的相互作用的实验...
CIRSPR/Cas9是一种在单条guide RNA(gRNA)的指导下利用Cas9核酸酶对靶标DNA进行特异性识别和切割的技术。该过程涉及到Cas9/gRNA与双链DNA(dsDNA)非特异性的结合、在dsDNA上搜索并识别PAM位点、通过与PAM上游的同源匹配形成RNA/DNA异源双链从而实现在dsDNA上靶点区域的特异性结合和切割。由于Cas9可以高效快捷地靶向并切割...
最近发表在《 基因 组生物学》上的研究发现了几个新的CRISPR-Cas12a位点,这是一种用于编辑哺乳动物 基因组 的CRISPR-Cas系统。本文的两位作者,李伟和滕飞,向我们介绍了他们的研究,以及如何增强和扩展基因组编辑工具箱。 在短短几年内,一项被称为CRISPR...
仅需体外合成sgRNA+PCR切割模板,无需载体构建和测序就能实现对靶点进行检测。即使零经验的师弟师妹们也能在2-3天内完成从实验材料准备到得到靶点切割结果。 spCas9体外酶切试剂盒:快速进行靶点筛选 酶切仅需30min 高效检测靶点 快速展开实验 显著提高基因...
2017 年 9 月 22 日 / 生物谷 BIOON/--- 在一项新的研究中,来自美国加州大学伯克利分校、麻省总医院、哈佛医学院和劳伦斯伯克利国家实验室的研究人员鉴定出 Cas9 蛋白中的一个关键区域决定着 CRISPR-Cas9 如何精准地对靶 DNA 序列进行编辑,对它进行微调可...
2017年10月6日/ 生物谷 BIOON/---在一项新的研究中,来自瑞典乌普萨拉大学的一个研究小组发现被称为分子剪刀(molecular scissors)的CRISPR-Cas9如何能够在基因组中寻找特定的DNA序列。Cas9已经在生物技术领域有了很多应用,也有望给医学带来革命性的变化。...
2017年9月7日, Journal of Neuroscience 杂志在线发表了中科院生物物理所陈畅课题组题为Increased GSNOR expression during aging impairs cognitive function and decreases S-nitrosation of CaMKII的研究论文。该论文首次揭示亚硝基化谷胱甘肽还原酶GSNO...
美国麻省总医院研发的高保真一种CRISPR-Cas9核酸酶有望提高spCas9核酸酶的特异性,极大降低的Cas9蛋白的脱靶率。该研究发表在Nature杂志上。...
北京英茂盛业新研发的Cas9体外酶切试剂盒完成体外酶切实验仅需30分钟,为您快速筛选有效靶点提供了便利的工具。...
通过采用Cas9 D10A突变蛋白,对DNA进行单链而不是双链切割,解决CRISPR/gRNA系统中的脱靶问题。...
RNA干扰靶序列设计的方法最初由 Elbashir et.al 2001 发表。之后由于发现了RISC与siRNA结合的偏好,设计干扰效果优秀的siRNA的成功率大大增加。我们主要采用 Pei and Tuschl ( N2[CG]N8[AUT]N8[AUT]N2 )发表的设计原则进行设计。对初步筛选出的所有符合条...