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sgRNA体外转录试剂盒(PC1380)
产品简介:
sgRNA体外转录试剂盒采用T7 RNA聚合酶复合物高效转录spCas9sgRNA。试剂盒中的反应体系根据sgRNA特点进行优化,每个反应可在4小时内获得多达100-200ug的sgRNA。sgRNA可直接用Cas9蛋白体外切割,纯化后可用于细胞注射等实验。
试剂盒中配备了合成sgRNA转录模板,sgRNA转录所需的全部试剂,用户仅需要合成含有1条CRISPR靶点的引物就能完成sgRNA体外转录。
产品内容:
储存条件:-20℃冻存
使用前必读注意事项:
!务必使用无RNA酶的枪头、离心管配制转录反应体系。
1、制备转录模板
1.1 设计PCR正向引物:
spCas9识别的靶点为20nt+NGG共23个碱基序列,我们以阳性对照的靶点序列为例说明设计引物的方法。
阳性对照的靶点序列为:
5’CTGCTAATCCTGTTACCAAGTGG-3’
需要合成的正向引物序列为:
5’TTAATACGACTCACTATAGGGCTGCTAATCCTGTTACCAAG GTTTTAGAGCTAGAAATA -3’
1.2 PCR扩增转录模板
反应体系:
正向引物(10 uM) | 0.8 ul |
SG-R primer | 0.8 ul |
PCR template DNA | 0.5 ul |
2 x PCR Mix | 10 ul |
H2O | 7.9 ul |
Positive control Primer(10 uM) | 0.8 ul |
SG-R primer | 0.8 ul |
PCR template DNA | 0.5 ul |
2 x PCR Mix | 10 ul |
H2O | 7.9 ul |
反应条件:
扩增产物为117bp。扩增完成后用2%琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物。
2、sgRNA转录
操作过程中采用无RNA酶的吸头及离心管操作,并注意避免RNA酶污染。
2.1 转录反应
按顺序加入以下反应物:
(1)反应体系:
无RNA酶水 | to 20 ul |
5 x Transcription Buffer | 4 ul |
NTP mix | 8 ul |
PCR产物 | 2 ul |
T7 Transcription Enzyme mix | 2 ul |
*20ul体系sgRNA产量为100-200ug。如果下游实验所需sgRNA量较少,可以根据需要适当调整体系,但尽量不低于5ul。
(2)转录条件:充分混匀,37℃孵育4小时。
*孵育时尽量采用PCR仪等带有热盖的仪器,或者在37℃恒温培养箱反应。切勿使用水浴锅。
(3)转录完成后取少量反应液,稀释20倍后用琼脂糖凝胶电泳检测产物大小及完整性。
转录产物全长序列:
5’-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTTAGAGCTAGAAATAGCAAGTTAAAATAAGGCTAGTCCGTTATCAACTTG
AAAAAGTGGCACCGAGTCGGTGCT-3’
电泳方法:
(1) 取1ul转录产物,加入19 ul无RNA酶水,混匀(稀释20倍)。
(2)取3ul稀释后样品,加入3ul 2 x RNALoading Buffer。70℃加热10min,立即放置冰上。
(3)用2%琼脂糖凝胶电泳检测条带。
3、转录产物纯化
* 转录产物可以直接用于Cas9体外酶切反应。纯化步骤选做。
* 转录模板DNA对Cas9体外酶切没有影响,可以不用去除。如果要去除模板DNA,可以先用DNase I消化转录反应液,再进行纯化。
* 可以选用可靠公司生产的RNA纯化试剂盒进行纯化或者乙醇沉淀纯化。乙醇沉淀纯化方法见电子版说明书。
4、RNA定量
转录得到的sgRNA可以采用紫外分光光度计定量。一般20ul体系可以得到sgRNA 100~200ug
相关产品:
使用本产品发表的文献:
https://www.maxapress.com/data/article/forres/preview/pdf/FR-2021-0016.pdf
Improving the Genome Editing Efficiency of CRISPR/Cas9 in Melon and Watermelon - PMC