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lncRNA qPCR检测服务
lncRNA是具有调控功能的长链非编码RNA,可用作新的潜在生物标志物。检测RNA最常用和简便的方法就是qPCR。然而,由于lncRNA的表达丰度通常较低,常规qPCR检测方法直接用于lncRNA检测面临一些困难。
针对lncRNA的特点,我们设计了专门的lncRNA qPCR检测方案。采用专门设计的反转录引物组和转录程序,保证内参和lncRNA得到可靠转录的同时,大幅降低无关基因的转录。我们优化了qPCR程序,加入了预扩增步骤,提高了检测的线性范围,并且提高了信号强度。经过优化,部分lncRNA的检测结果从Ct值40以上,提高到了27-29,可以可靠的分析lncRNA的表达量变化。
反转录方案设计
常规的反转录采用六核苷酸随机引物、oligo dT引物或者二者的组合进行反转录。经过我们的实践,这两种引物检测lncRNA效果均不好。分析原因有两点。第一,lncRNA并不一定带有polyA尾,导致不能转录。第二,六核苷酸随机引物对于高丰度、较长的基因转录量偏大。对于低丰度、长度短的基因转录量偏低。二者结合造成了对lncRNA极低的转录效率。
针对以上情况,我们设计了针对lncRNA和内参基因设计数条特异引物的转录方案。这种转录方案中的转录引物和酶都过量,转录产物量由体系中的lncRNA含量决定,而不会受到大量无关基因的干扰,适合检测已知lncRNA。
qPCR反应的优化
我们还改进了qPCR的检测程序,在常规检测程序前加入touch down预扩增步骤,在提高特异性的同时,放大进入qPCR检测的模板量。
经过系列优化,lncRNA检测成功率和准确性得到保证。
客户送检提供内容:
待测样品:新鲜组织样品>100mg;RNA样品>5ug。
资料:待测基因序列或者登录号。
lncRNA qPCR检测服务提交的报告:
完整的实验报告,包括使用的试剂、引物序列、仪器信息等。
实验结果数据原始文件及分析软件;扩增曲线、溶解曲线、结果分析。
我们也提供相关的lncRNA稳转细胞株服务、lncRNA表达载体构建等,欢迎客户垂询!