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一、试剂
1. 细胞培养基及其他细胞培养所需试剂。
2. 转染辅助试剂Polybrene(用水配制为6mg/ml,-20℃冻存)。
3. Cas9表达慢病毒(制备方法见Cas9慢病毒包装实验)。
4. 嘌呤霉素或者G418。
二、实验步骤
1、 转染前24小时将293T以适当密度铺板到12孔板。感染病毒时细胞密度在80%左右。
2、 取出制备好的Cas9表达慢病毒(pLV-Cas9-Puro包装得到,制备方法见Cas9慢病毒包装实验),室温融化。按照下面的方法准备慢病毒感染液:
以感染1个12孔板细胞(细胞培养基体积1ml)为例
1)病毒液 50ul
2)细胞完全培养基到950ul
3) 加入Polybrene到终浓度为6ug/ml
3、 用病毒感染液替换原细胞培养基,继续培养24小时。用新鲜的培养基替换病毒感染液。
4、 病毒感染48小时后,转入的基因开始表达。这时可以加入嘌呤霉素至终浓度为3ug/ml。
5、 在筛选过程中为维持抗生素合适的浓度和细胞营养,每隔2-3天应该换液一次,去除死细胞,补加抗生素。
6、 大约6-7天,细胞不再死亡。扩大培养筛选得到的细胞,进行检测。
三、PCR检测细胞基因组中的Cas9基因
用基因组PCR检测293T-Cas9细胞中的Cas9基因。
鉴定引物:
Cas9-F:ACAGTCTTCACGAGCACATC
Cas9-R:TCCTCTTCATCCTTTCCCTA
产物大小198bp
步骤:
1、 分别提取293T-Cas9细胞和293T细胞的基因组DNA。
2、 PCR扩增
反应体系:
2×Taq Mix 25ul
Cas9-F(10uM)2ul
Cas9-R(10uM)2ul
基因组模板 5ul
加水补足50ul
反应条件:95℃ 预变性5min;95℃ 30sec,55℃ 30sec,72℃ 30sec,35个循环。
3、 电泳检测PCR产物
M:DL2000 DNA marker
1:293T-Cas9扩增产物
2:293T扩增产物
四、 相关实验
五、 相关产品